A rendszeres kávéfogyasztás (mind a koffeintartalmú, mind a koffeinmentes) alapvetően megváltoztatja a bélmikrobiomot, hatással van a gyulladásokra és a kognitív funkciókra.
A University College Cork munkatársa, John F. Cryan kéthetes kávémegvonási programot vezetett 62 felnőtt bevonásával, majd három hétig visszatértek a kávéfogyasztáshoz. A vizsgálat kezdetén a kávéfogyasztók mikrobiomja szignifikánsan eltért a nem fogyasztókétól, és a vérben lévő gyulladásos markerek is alacsonyabbak voltak. A kéthetes kávémegvonás csökkentette a vérnyomást, de növelte a gyulladásos markerek szintjét. Egyes bélbaktériumok eltűntek, de egy molekula, amely erősíti a bélnyálkahártyát, helyreállt.
A koffein nem tudta megmagyarázni a változások nagy részét: a koffeinmentes kávéra való visszatérés ugyanazokat a mikrobiális eltolódásokat okozta, mint a hagyományos kávé, míg a koffein csak a kortizolszintet, a szorongást és néhány vizeletben lévő metabolitot érintette. A kávéról leszokó csoport, amely ezután visszatért az iváshoz, javult a verbális memóriában, míg azoknál, akik visszatértek a koffeinhez, nem mutatkozott javulás. A legváratlanabb eredmény a GABA (egy nyugtató neurotranszmitter) és az indol-3-propionsav (a kognitív egészséggel összefüggésben álló) szintjének csökkenése volt a kávéfogyasztók székletében a nem ivókhoz képest.
A szerzők arra a következtetésre jutottak, hogy a kávé hatékony modulátora a bél-agy tengelynek, és könnyen hozzáférhető táplálkozási eszközként szolgálhat a stresszkezelés és a kognitív egészség szempontjából.
